La prima partita ufficiale del franchise si è svolta nella primavera del 1999. In precedenza, la squadra giocava con il nome di Durham Bulls, ma dopo il trasferimento ha cambiato la sua identità di marchio.
Dal 1999, il logo della squadra della Carolina League Myrtle Beach Pelicans è basato su una rappresentazione stilizzata di un pellicano. Non era lo stesso pellicano, però.
Il logo di Myrtle Beach Pelicans del 1999 presentava un pellicano antropomorfizzato su grandi lettere verde acqua “MB”. La creatura teneva un pipistrello nelle sue “mani”.
A differenza del suo predecessore, il pellicano del logo del 2007 assomiglia più a un uccello che a un giocatore di baseball. È in piedi su una mazza da baseball nello stesso modo in cui qualsiasi uccello sta su un ramoscello.
La combinazione di colori aggiornata combina due tonalità di blu con il giallo e il bianco.
